Quantitative phosphoproteomics for the characterization of differentiation of neural stem cells

  • Neurale Stammzellen stellen den Ursprung des gesamten zentralen Nervensystems dar. Dabei spielen diverse Signalwege eine Rolle, deren Regulation auf Basis post-translationaler Modifizierung (PTM) erfolgt. Ziel dieser Arbeit war daher die umfassende Analyse zugrundeliegender Änderungen im Proteom und Phosphoproteom der Zelle. Das erstellte Protokoll konnte mit großem Erfolg zum Einsatz gebracht werden. Die quantitative Analyse der Proben mittels Massenspektrometrie resultierte in der Identifizierung von mehr als 4.000 Proteinen und Phosphopeptiden. Unter den als reguliert identifizierten Kandidaten fanden sich zentrale Schaltstellen intrazellulärer Signalwege wie Cyclin-abhängige Kinasen (CDKs) und GTPasen der Rho-Familie wie Cdc42 oder Rac1 oder Vertreter der MapK-Familie. Während manche Proteine und Phosphorylierungsstellen bereits im Kontext der NSC-Differenzierung beschrieben waren, konnten weitere und bisher eher unbekannte mögliche Effektoren identifiziert werden.

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Metadaten
Author:Thilo LerariGND
URN:urn:nbn:de:hbz:294-59585
Title Additional (German):Quantitative Phosphoproteomik zur Charakterisierung der Differenzierung neuraler Stammzellen
Referee:Helmut E. MeyerGND, Andreas FaissnerORCiDGND
Document Type:Doctoral Thesis
Language:English
Date of Publication (online):2018/07/17
Date of first Publication:2018/07/17
Publishing Institution:Ruhr-Universität Bochum, Universitätsbibliothek
Granting Institution:Ruhr-Universität Bochum, Fakultät für Biologie und Biotechnologie
Date of final exam:2016/10/27
Creating Corporation:Fakultät für Biologie und Biotechnologie
GND-Keyword:Stammzelle; Proteomanalyse; Massenspektroemtrie; Zelldifferenzierung; Phosphorylierung
Institutes/Facilities:Medizinisches Proteom-Center
Dewey Decimal Classification:Technik, Medizin, angewandte Wissenschaften / Medizin, Gesundheit
faculties:Fakultät für Biologie und Biotechnologie
Licence (German):License LogoKeine Creative Commons Lizenz - es gelten der Veröffentlichungsvertrag und das deutsche Urheberrecht