Introduction
Les staphylocoques sont des bactéries commensales cocci Gram positif et catalase positive regroupant principalement 2 espèces, le staphylocoque doré (S.aureus) et les autres staphylocoques dits « coagulase négative ». 20 à 30% des personnes en bonne santé sont colonisées par S.aureus, préférentiellement au niveau nasal, mais également au niveau de la gorge, des plis inguinaux, des aisselles, etc. Cette bactérie, connue pour être une des causes majeures de diverses infections nosocomiales pyogènes, possède deux autres facteurs de virulence pouvant être utilisés au laboratoire pour son diagnostic : la coagulase et la protéine A. En 1940, la pénicilline, un antibiotique de la classe des bêta-lactamines agissant en inhibant la synthèse de la paroi bactérienne en se liant à une protéine transmembranaire appelée Penicillin-Binding Protein (PBP), arrive sur le marché pour le traitement des infections dues à ce germe. 8 ans plus tard, S.aureus développe une première résistance consistant en une enzyme, la bêta-lactamase (pénicillinase), hydrolysant l’anneau bêta-lactame de l’antibiotique. De nouveaux antibiotiques résistants à la pénicillinase, comme la méticilline, arrivent sur le marché en 1959. Rapidement, de nouvelles souches résistantes, cette fois dues à l’acquisition du gène mecA ou mecC synthétisant une PBP modifiée appelée PBP2a maintenant l’intégrité de la paroi bactérienne, sont rapportées. Les S.aureus résistants sont connus sous le nom de MRSA (methicillin-resistant Staphylococcus aureus).
Les infections nosocomiales, caractérisées par des germes multi-résistants, sont devenues une préoccupation majeure dans les établissements de soins au vu de la morbi-mortalité et des coûts qui leur sont associés. De ce fait, le dépistage des porteurs de MRSA fait partie du programme de prévention des infections où la culture est considérée comme « gold standard ». Néanmoins, son délai de traitement est de minimum 2 jours. Il est donc important de disposer d’un test rapide visant cinq objectifs : un dépistage et une surveillance active de ces porteurs, le contrôle de sa propagation par la mise en place précoce de mesures de contact additionnelles, une meilleure gestion du flux de patients, l’évitement d’un isolement préemptif ayant un prix considérable et nécessitant de la place dans l’établissement, et finalement un traitement ciblé d’entrée.
Pour cette étude, nous allons nous focaliser sur 3 versions consécutives d’un test rapide par PCR en temps réel détectant et amplifiant certaines séquences spécifiques de l’ADN du Staphycoloccus aureus résistant à la méticilline.
Notre étude comporte deux objectifs. Le premier objectif étant de définir la performance des trois tests rapides et le deuxième étant d’investiguer les discordances entre les résultats des tests rapides et la culture.