Molecular functional analysis of the tumor suppressor gene PDCD4

Das Pdcd4-Gen (Programmed Cell Death 4) ist ein neues Tumorsupressorgen, das ursprünglich als ein während der Apoptose aktiviertes Gen identifiziert wurde. Um die molekularen Funktionen des Pdcd4 Tumorsuppressorgens zu charakterisieren, wurde ein Knock-Down-System mittels RNAi Technologie und ein Kn...

Verfasser: Marikkannu, Rajeshwari
Weitere Beteiligte: Klempnauer, Karl-Heinz (Gutachter)
FB/Einrichtung:FB 12: Chemie und Pharmazie
Dokumenttypen:Dissertation/Habilitation
Medientypen:Text
Erscheinungsdatum:2006
Publikation in MIAMI:06.12.2006
Datum der letzten Änderung:24.06.2021
Angaben zur Ausgabe:[Electronic ed.]
Schlagwörter:Pdcd4; Tumorsupressorgen; siRNA Technologie; 2D-SDS-PAGE; Cytokeratin; mRNA-Stabilität; Massenspektrometrie
Fachgebiet (DDC):540: Chemie
Lizenz:InC 1.0
Sprache:English
Format:PDF-Dokument
URN:urn:nbn:de:hbz:6-10659546598
Permalink:https://nbn-resolving.de/urn:nbn:de:hbz:6-10659546598
Onlinezugriff:diss_marikkannu.pdf

Das Pdcd4-Gen (Programmed Cell Death 4) ist ein neues Tumorsupressorgen, das ursprünglich als ein während der Apoptose aktiviertes Gen identifiziert wurde. Um die molekularen Funktionen des Pdcd4 Tumorsuppressorgens zu charakterisieren, wurde ein Knock-Down-System mittels RNAi Technologie und ein Knock Out System mittels homologer Rekombination entwickelt. Mittels der 1D SDS PAGE- und der 2D-SDS-PAGE-Analyse konnten einige Transkriptionsfaktoren (ATF 2, c Myc, c Jun, CEBPß) sowie folgende Proteine als Pdcd4-Zielproteine identifiziert werden: Cytokeratin 17 (CK 17), Cytokeratin 8 (CK 8) und C2 und C3, die zur Familie der Aldo-Keton-Reduktase 1 (AKR1) gehören, sowie die Glutamyl Prolyl Bifunctional tRNA synthetase (GluProRS). Diese beiden hier entwickelten Systeme sowie die hier identifizierten Zielproteine könnten zur Klärung der molekularen Funktionen des Tumorsuppressor Pdcd4 beitragen. The Programmed Cell Death 4 gene (Pdcd4) is a novel tumor suppressor gene originally identified as a gene upregulated during apoptosis. To study the molecular functions of the Pdcd4 tumor suppressor gene by a reverse genetic approach, a knock down system and a knock-out system were developed in the HeLa cells using siRNA mediated RNA interference (RNAi) and in the DT40 cells using homologous recombination, respectively. The 1D and 2D SDS PAGE analysis in HeLa cells identified several transcription factors (ATF-2, c-Myc, c-Jun, CEBPß) and proteins viz., cytokeratin 17 (CK 17), Aldo Keto Reductase 1 (AKR1) family members C2 and C3, cytokeratin 8 (CK 8) and Glutamyl Prolyl Bifunctional tRNA synthetase (GluProRS) as novel molecular targets of Pdcd4. The two systems developed in the present work will be useful in further elucidating the molecular functions of tumor suppressor Pdcd4 by utilizing the molecular targets identified here.