Die vorliegende Arbeit befasst sich zunächst mit der Untersuchung von Submonolagenbedeckungen des Porphyrin-Derivats FeOEP-Cl auf Cu( 111 ) mit Hilfe der Rastertunnelmikroskopie. Basierend auf temperaturabhängigen Experimenten und DFT Simulationen konnte eine oberflächeninduzierte Dechlorierung von FeOEP-Cl bei der Adsorption auf Cu( 111 ) festgestellt werden. Anhand einer umfassenden statistischen Analyse für verschiedene Präparationsparameter, wie z.B. der Temperatur, konnte ein weiterer oberflächeninduzierten Dechlorierungsprozess nachgewiesen werden. Moleküle, die an der oberen Seite einer monoatomaren Cu( 111 ) Stufenkante adsorbieren, erfahren an dieser Position eine erhöhte Wahrscheinlichkeit für eine Dechlorierung. Dies kann möglicherweise auf eine neue Adsorptionsgeometrie und veränderte elektronischen Struktur der Moleküle an der Stufenkante zurückgeführt werden. Durch eine Erhitzung der molekülbedeckten Cu( 111 ) Oberfläche erfährt FeOEP-Cl eine Transformation zu FeTBP. Hierbei passiert eine oberflächenunterstützte Dehydrogenisierung der ursprünglichen acht Ethylgruppen (EG). Ethylgruppen werden durch den Verlust von zwei H-Atomen zu Vinylgruppen transformiert. Anschließend wird durch einen elektrocyclischen Ringschluss zweier Vinylgruppen unter dem Verlust zweier weiterer H-Atome ein Benzolring gebildet. Mit einer statistischen Analyse der Oberflächenprodukte nach thermischer Behandlung konnte die Aktivierungsenergie für die Reaktion einer Ethylgruppe zu E = 1.4 eV bestimmt werden. Obwohl es nicht möglich ist, die Reaktion von einem individuellen Molekül zu verfolgen, kann der komplette Reaktionspfad mit 16 unterschiedlichen Zwischenzuständen, die in bis zu vier verschiedene Adsorptionskonfigurationen vorliegen können, und den Raten der involvierten Prozesse enthüllt werden. Dies wurde durch einen Vergleich der statistischen Analyse eines großen STM Datensatzes mit mehreren tausend Molekülen in verschiedenen Phasen der Transformation und einer numerischen Simulation erreicht. Es hat sich herausgestellt, dass ein Ratenmodell mit lediglich vier Raten die experimentellen Daten gut beschreiben kann. Vorherige Reaktionen an anderen Teilen des Moleküls spielen keine Rolle, so dass Dechlorierung und Dehydrogenisierung als lokale Prozesse beschrieben werden können. Sowohl der Chlorligand als auch die Ethylgruppen konnten durch eine lokale Manipulation unter Verwendung des STMs entfernt werden. Während eine Dechlorierung nur unter Verwendung einer W-Spitze erreicht werden konnte, war die Manipulation einer Ethylgruppen sowohl durch eine W- als auch durch eine PtIr-Spitze erfolgreich. Die Herstellung einer geordneten 2 D-Mischschicht aus FeTBP und das Perylen-Derivat PTCDA gelang nicht. Jedoch konnten zwei unterschiedliche eindimensionale Kettenstrukturen hergestellt werden. Während die erste Kettenstruktur alternierend aus FeTBP und PTCDA Molekülen besteht, setzt sich die zweite Struktur aus PTCDA Molekülen zusammen, die durch ein rund erscheinendes Element verbunden sind. Dies könnte der vormalige Chlorligand von einem FeOEP sein. An einer CO bedeckten Cu(111) Oberfläche konnten verschieden geordnete CO Strukturen präpariert werden. Dabei konnte zwischen zwei unterschiedlichen Phasen von CO auf Cu(111) bei T=80 K ein zweidimensionaler, struktureller, reversibler Phasenübergang 1.Ordnung beobachtet werden. Die Strukturen beider Phasen konnten unterstützt durch theoretische Rechnungen bestimmt werden. In dem vorliegenden System ist eine lokale Manipulation der Phasen durch Anlegen eines externen elektrischen Feldes mittels der Tunnelspitze möglich. Aufgrund der experimentellen Einfachheit kann dieses System als ein Modellsystem für die Untersuchung fundamentaler Eigenschaften von Phasenübergängen dienen.