Der archaeale Transkriptionsapparat umfasst eine aus mehreren Untereinheiten aufgebaute RNA Polymerase (RNAP), die der RNAPII von Eukaryonten ähnelt, sowie Homologe des TATA-Bindeproteins (TBP) und der Transkriptionsfaktoren TFIIB (TFB) und TFIIE (TFE) (Langer und Zillig, 1993, Marsh et al., 1994, Langer et al., 1995, Kyrpides und Ouzounis 1999, Bell und Jackson 1998a, b, Bell and Jackson, 2001, Hickey et al., 2002, Geiduscheck und Ouhammouch, 2005, Werner und Grohmann, 2011). Das momentane mechanistische Verständnis der Transkriptionsinitiation besagt, dass TBP an die TATA-box bindet (~ 25 bp stromaufwärts des Transkriptionsstarts). Anschließend bindet TFB an den TBP-DNA Komplex und bildet dabei sequenzspezifische Kontakte mit dem purinreichen TFB-responsive element (BRE). Daraufhin bindet die RNAP an den N-terminus von TFB um den prä-Initiationskomplex zu bilden. In vitro Studien zeigten, dass die RNAP, TBP und TFB für die Transkription archaealer Promotoren ausreichen (Bell and Jackson 1998a, b, Bell und Jackson, 2001, Hickey et al., 2002, Geiduscheck and Ouhammouch, 2005). Deshalb wird Transkription als vereinfachtes Modell für komplexere Transkriptionsvorgänge in Eukaryonten betrachtet (Baliga et al. 2000). Bei Euryarchaeota wurden multiple TFB und TBP Homologe bereits hinreichend untersucht wohingegen die Rolle multipler GTFS in Crenarchaeota weitestgehend unbekannt ist. Möglicherweise fungieren verschiedene TFB Homologe in ähnlicher Weise wie σ-Faktoren in Bakterien und führen eine spezialisierte Funktion als Stressantwort aus. (Micorescu et al., 2008, Peng et al., 2009, Paytubi and White, 2009). Ziel dieser Arbeit war es alle generellen Transkriptionsfaktoren von S. acidocaldarius, die für weitere Experimente wie EMSAs und in vitro Transkription benötigt werden zu exprimieren und zu reinigen, um schließlich die Funktion multipler Transkriptionsfaktoren mit Hilfe weiterer Experimente (Reportergenkonstrukte, Protein-Protein Interaktionsstudien, Knock-out Mutanten) aufzudecken. Der thermoacidophile Organismus S. acidocaldarius wächst optimal bei einer Temperatur von 80°C und einem pH von 2-3 (Brock et al., 1972) und ist obligat aerob. S. acidocaldarius wächst heterotroph und nur auf wenigen von Polysacchariden und Aminosäuren (Dextrin, Stärke, Trypton, Glutamat) (Grogan et al., 1989). Das bereits etablierte genetische System von S. acidocaldarius (Wagner et al., 2009, Wagner et al., 2012, Sakofsky et al., 2011), das ein Expressionssystem und die Generierung von Knock-out Mutanten umfasst, bietet einen großen Vorteil gegenüber der Forschung mit anderen Crenarchaeota wie T. tenax. Die Funktion von TFB1 und TFB3 wurde bislang nur in wenigen Crenarchaeota untersucht (Bell and Jackson, 2000a, Götz et al., 2007, Paytubi and White, 2009). Ein erster Hinweis auf eine Zellzyklus-abhängige Funktion von TFB2 wurde durch Microarray Studien aufgedeckt (Lundgren and Bernander, 2011). Jedoch wurde TFB2 von S. acidocaldarius bisher nicht auf Proteinebene untersucht. Die Rolle von GTFs in S. acidocaldarius wurde durch Expression der Proteine, Reportergen assays, Protein-Protein Interaktionsstudien mit der RNAP und GTFs sowie durch knock-out Mutanten für die Untersuchung der in vivo Funktion untersucht. Zusammenfassend ist zu sagen, dass diese Arbeit eine fundamentale Basis für weitere Experimente (z.B. rekombinante Proteine, His-Tag RNAP, Reportergen Konstrukte) bietet. Zudem wurde eine mögliche Rolle von TFB2 in Transkription von RNA Genen und RNA Modifikation dargelegt und die Funktion von TFB3 als Transkriptionsaktivator untermauert.