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Mathematical Problems in Molecular Evolution and Next Generation Sequencing

Kobert, Kassian

Abstract:

The focus of this work is the development of new mathematical methods for problems in phylogenetic tree inferences.

In the first part we solve several problems related to so-called partitioned alignments.

In the second part we demonstrate how to calculate all identical subtrees of a given labeled tree. We make use of this to implement an efficient method for avoiding redundant likelihood operations during phylogenetic tree inferences.


Volltext §
DOI: 10.5445/IR/1000056076
Cover der Publikation
Zugehörige Institution(en) am KIT Institut für Theoretische Informatik (ITI)
Publikationstyp Hochschulschrift
Publikationsjahr 2016
Sprache Englisch
Identifikator urn:nbn:de:swb:90-560768
KITopen-ID: 1000056076
Verlag Karlsruher Institut für Technologie (KIT)
Umfang 171 S.
Art der Arbeit Dissertation
Fakultät Fakultät für Informatik (INFORMATIK)
Institut Institut für Theoretische Informatik (ITI)
Prüfungsdaten 02.05.2016
Referent/Betreuer Stamatakis, A.
KIT – Die Forschungsuniversität in der Helmholtz-Gemeinschaft
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