Contexte : Les dermatophytes sont des champignons filamenteux parasites spécialisés qui
dégradent les tissus kératinisés. Ils sont responsables de la plupart des mycoses de la peau, du
cuir chevelu et des cheveux, et des ongles. Le choix du traitement des dermatophytoses dépend
des symptômes et du dermatophyte incriminé parmi une quinzaine d'espèces possibles.
L'identification des dermatophytes se fait en général sur la base des caractères macroscopiques et
microscopiques des cultures. L'identification est parfois difficile ou reste incertaine car il peut y
avoir des variations d'un isolat à l'autre au sein d'une même espèce. Cependant, les espèces sont
facilement identifiées sur la base de séquences d'ADN. En pratique, des séquences d'ADN
ribosomique suffisamment polymorphes sont le plus souvent utilisées pour discriminer les
espèces de dermatophytes.
Des méthodes spécialisées et sophistiquées telles que les séquences d'ADN et la spectrométrie de
masse sont de plus en plus proposées dans la littérature pour identifier les dermatophytes.
Toutefois, ces méthodes ne peuvent pas être utilisées directement par un médecin dans un
cabinet médical. C'est pourquoi des méthodes plus simples basées sur l'observation de caractères
phénotypiques des champignons en culture ne devraient pas être abandonnées.
Objectif : Etablir une clé d'identification dichotomique se basant sur des caractères
macroscopiques et microscopiques permettant une identification fiable du dermatophyte par la
culture. Des clés d'identification des espèces seront élaborées et testées pour leur validation en
parallèle avec leur identification par des méthodes de Biologie Moléculaire. Créer un outil simple
qui pourra être utilisé au laboratoire par des médecins ou des biologistes non spécialisés en
mycologie pour identifier les dermatophytes sans avoir recours à une technologie sophistiquée.
Méthodes :
Inventaire des espèces isolées de 2001 à 2012 au laboratoire de dermatologie du CHUV.
Inventaire des caractères phénotypiques permettant de caractériser chaque espèce.
Création d'un système dichotomique sur la base des caractères phénotypiques pour séparer et
identifier les espèces (clé d'identification des espèces).
Résultats attendus : Les résultats attendus sont définis au niveau des objectifs. L'outil doit être
accessible pour des personnes inexpérimentées qui pourront alors identifier les dermatophytes.
Plus-value : Les dermatophytoses sont fréquemment diagnostiquées. Cet outil est destiné à tous
les dermatologues installés et au personnel de laboratoire qui ne sont pas nécessairement
spécialisés en la matière.